Ylläpitäjä hallinnoi Moodlen asetuksia, asentaa lisämoduuleja jne.
Ylläpitäjätasoja ovat:
- Pääylläpitäjä (primary administrator), joka hallinnoi Moodlen palvelin- ja ohjelmistoasetuksia
- Hallinnoija (manager), joka voi muokata Moodlen ylläpitoasetuksia ja
- Kurssinluoja (course creator), joka voi luoda uusia kursseja ja opettaa niissä.
Sisällysluettelossa on lisää ylläpitäjien tehtäviin liittyviä aiheita.